Colegas, como sou da área acho que posso fazer algumas considerações:
1-Ciências da computação usa a informática como principio.
Este curso é para quem quer desenvolver linguagens de programação, sistemas operacionais etc.
2-Engenharia da computação usa a informática como meio.
Este curso é indicado para quem quer fazer automatização de máquinas via computador (é um curso interessante mas não tem tantas vagas por ai, somente nos grandes polos industriais) a vantagem deste curso é que vc se torna um engenheiro, abrindo assim um enorme leque de opções para fazer alguma pós tipo: engenharia de produção, engenharia de segurança no trabalho, engenharia ambiental etc
3-Sistemas de informação usa a informática como fim.
É o curso mais promissor dos 3 (segundo o ex ministro da educação) porque neste curso além da pessoa aprender a desenvolver sistemas ensina também noções de administração. O que torna este profissional bem cobiçado pelas grandes empresas.
Eu tb recomendo este 3º, maiores informações poderão ser obtidas na página do ministério da educação.